Clubul FCM Tîrgu-Mureș a fost fondat în anul 2008.
Debutul în Liga a II-a are loc în ediția 2008/2009, FCM Tîrgu-Mureș preluând secția de fotbal a clubului Unirea Sânnicolau Mare. Chiar la debutul pe cea de-a doua scenă a fotbalului românesc, echipa se clasează pe un merituos loc III, luptând până aproape de final pentru promovare.
În ediția 2009/2010, FCM Tîrgu-Mureș termină campionatul pe prima poziție a seriei a II-a și reușește, în premieră, promovarea în Liga 1.
Primul sezon în Liga 1, ediția 2010/2011, se încheie cu o clasare fantastică, locul 8, depășind și campioana en-titre, CFR Cluj-Napoca.
Din păcate, în al doilea sezon petrecut în Liga 1, ediția 2011/2012, evoluția nu a fost la fel de bună, iar echipa s-a clasat pe locul 15, primul sub linie, retrogradând în Liga a II-a.
În ediția 2012/2013 a Ligii a II-a, FCM Tîrgu-Mureș a ocupat în final locul 5, nereușind să-și îndeplinească obiectivul stabilit, revenirea în prima ligă.
În vara anului 2013, FCM Tîrgu-Mureș a demarat un amplu proces de reorganizare, atât la nivelul conducerii executive, cât și la nivelul celei tehnice. Intenția a fost aceea de a crea la Tîrgu-Mureș un adevărat centru fotbalistic, prin revitalizarea Centrului de Copii și Juniori, care să pregătească jucători de valoare pentru prima echipă.
În vederea îndeplinirii acestui obiectiv se va pune un mare accent pe tradiția fotbalistică din Tîrgu-Mureș și județul Mureș, cu influențe în toată zona Ardeal-ului. Astfel, denumirea echipei a fost modificată, prin preluarea numelui formației de tradiție a orașului, ASA și a culorilor roșu-albastru. Pe lângă noua stemă a echipei, va fi folosit și motto-ul „Un nume. O tradiție”.
Formația a reușit promovarea în Liga 1, la finalul play-off-ului, iar în sezonul 2014/2015 al Ligii 1, ca nou-promovată, a obținut o performanță deosebită: locul 2, luptând până în ultimele minute ale campionatului pentru titlu, după un retur senzațional, în care a recuperat o diferență de 13 puncte.
Debutul sezonului 2015/2016 a adus și primul trofeu al echipei, Supercupa României, după victoria cu 1-0 în fața campioanei Steaua, într-o partidă disputată la Constanța. Finalul sezonului a adus calificarea în play-off și un loc 6 la sfârșitul sezonului.
ASA Tîrgu-Mureș a participat în ediția 2015/2016 a UEFA Europa League, fiind eliminată în turul III de către echipa franceză St. Etienne, după 0-3 pe teren propriu și o victorie, 2-1 în deplasare.
PERFORMANȚE
2014/2015 – Vicecampioană națională Liga 1
2015 – câștigătoare Supercupa României (1-0 cu Steaua București)